ประเทศไทยถือเป็นหนึ่งในประเทศหุ้นส่วนสำคัญของ ICBiotech ในภูมิภาคเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ โดยในปี ค.ศ. 2002 ศูนย์ได้จัดตั้ง Collaborative Research Station (CRS) ณ มหาวิทยาลัยมหิดล เพื่อเป็นฐานสำหรับการวิจัยภาคสนาม การแลกเปลี่ยนทางวิชาการ และกิจกรรมความร่วมมือที่เชื่อมโยงประเทศไทยกับประเทศเพื่อนบ้านในภูมิภาค
นอกเหนือจากความร่วมมือกับมหาวิทยาลัยมหิดลแล้ว ICBiotech ยังได้พัฒนาความร่วมมืออย่างเป็นทางการและต่อเนื่องกับสถาบันชั้นนำของไทยอีกหลายแห่ง ได้แก่ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี (KMUTT) และสำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ (สวทช.) โดยความร่วมมือดังกล่าวครอบคลุมการวิจัยร่วม การแลกเปลี่ยนนักศึกษาและนักวิจัย การฝึกอบรมทางวิชาการ และการพัฒนาเครือข่ายด้านเทคโนโลยีชีวภาพในระดับภูมิภาค